Por longa tradição, recentemente reforçada pela Santa Sé, o estudo da Teologia começa por um ciclo com a duração de 10 semestres. Na adequação do mesmo à atual lei portuguesa, este ciclo considera-se um "Ciclo de Estudos Integrados" conducente ao grau de Mestre. O Mestrado Integrado em Teologia (MIT) tem, assim, a duração de 5 anos e corresponde a 300 ECTS, sendo leccionado em horário diurno (das 8h30 às 13h00).

No espírito da atual legislação (DL 74/2006, artº 19), a Faculdade confere a quem o requeira e tenha frequentado com aproveitamento 180 ECTS de unidades curriculares nucleares pré-definidas do MIT [1], o grau de Licenciado em Ciências Religiosas.